Krajowe przedsiębiorstwa, działające na rynkach sektora morskiego, energetycznego i telekomunikacyjnego, z którymi Instytut Morski współpracował w niedalekiej przeszłości (w szczególności firmy prowadzące eksplorację dna morskiego oraz firmy projektowe, konsultingowe, hydrotechniczne i budowlane):

• Zarząd Morskiego Portu Gdynia S.A.
• Zarząd Morskiego Portu Gdańsk S.A.
• Zarząd Morskich Portów Szczecin – Świnoujście S.A.
• Przedsiębiorstwo Badań i Doradztwa Sp. z o.o. GEOMOR
• Przedsiębiorstwo Doradztwa Technicznego GEOMOR–TECHNIK sp. z o.o.
• SeaBed Polska Sp. z o.o.
• Biuro Projektów WUPROHYD Sp. z o.o.
• MEGA S.A.
• GEO-KAT Sp. z o.o.
• GOKART International Sp. z o.o.
• Geofizyka Toruń Sp. z o.o.
• Bałtycka Agencja Poszanowania Energii S.A.
• Polska Grupa Energetyczna S.A 
• GENERPOL Sp. z o.o.
• Koncern Energetyczny Energa S.A.
• Wiatropol International Sp. z o.o.
• Energoprojekt Warszawa Sp z o.o.
• SwePol Link Ltd
• EVELPOL Sp. z o.o.
• PERTOBALTIC S.A.
• PRCIP Sp. z o.o.
• Morska Agencja Gdynia LTD
• MOEBIUS – Bau Polska Sp. z o.o.
• UNIGEO Badania Geotechniczne Oktawa Tomasz
• Hydrobudowa S.A.
• NAVIMOR – INVEST Sp. z o.o.
• BUDMORS Consulting sp. z o.o. 
• Przedsiębiorstwo Robót Podwodnych i Hydrotechnicznych „MARINEX” Sp. z o.o.
• Pracownia Projektowa Budownictwa Hydrotechnicznego AQUAPROJEKT Sp. z o.o
• PROJMORS Biuro Projektów Budownictwa Morskiego Sp. z o.o.
• ELEKTROCIEPŁOWNIE WYBRZEŻE S.A.
• Geoprojekt Gdańsk Sp. z o.o.
• Hydroprojekt Sp. z o.o.
• GEOBAD – Zakład Badań Geologicznych i Robót Inżynierskich
• Przedsiębiorstwo Wodociągów i Kanalizacji Sp. z o.o. w Gdyni