Projekt badawczy (2 PO4F 04528) finansowany jest przez Ministra Nauki i Informatyzacji. Czas realizacji projektu: kwiecień 2005 - grudzień 2006.

Kierownik tematu: Andrzej Osowiecki,
Rejon badań: Rowy (środkowe wybrzeże),
Zleceniodawca: Minister Nauki i Informatyzacji Warszawa,
Termin zakończenia: grudzień 2006 r.

Kierownik tematu: Andrzej Osowiecki,
Rejon badań: Rowy (środkowe wybrzeże),
Zleceniodawca: : Ministerstwo Środowiska i Narodowy Fundusz Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej,
Termin zakończenia: maj 2007 r.

Opracowanie podstaw do analizy uwarunkowań biocenotycznych dla planowanego zrzutu ścieków kolektorem podmorskim z oczyszczalni ścieków "Dębogórze" do Zatoki Puckiej, realizowanej w ramach projektu pt. "Analiza techniczno-ekonomiczna budowy głębokowodnego kolektora odprowadzającego ścieki z oczyszczalni "Dębogórze".

Kierownik tematu: Lidia Kruk-Dowgiałło,
Rejon badań: Zatoka Pucka - rejon Mechelinek,
Zleceniodawca: : SAFEGE S.A. Oddział w Polsce Warszawa,
Termin zakończenia: styczeń 2006 r.

Wykonanie oznaczenia chlorofilu "a" w II, III i IV kwartale 2005 r i w I kw. 2006 r. w ciekach Gminy Gdańsk, wchodzącego do pracy Monitoring wód powierzchniowych wraz z obliczeniem ładunku zanieczyszczeń odprowadzanych z Gminy Gdańsk do Zatoki Gdańskiej w roku 2005.

Kierownik tematu: Jacek Nowacki (w IM Danuta Rybicka),
Rejon badań: cieki Gdańska,
Zleceniodawca: Akademia Medyczna w Gdańsku,
Termin zakończenia: marzec 2006 r.

W dniach 24-28 maja 2006 roku R. Opioła i M. Kuliński uczestniczyli w warsztatach "Baltic Life Marine Habitat Seminar" dotyczących wykorzystania swobodnego nurkowania oraz zdalnych technik video w mapowaniu oraz monitorowaniu siedlisk podwodnych.

Warsztaty były zorganizowane przez Estoński Instytut Morski w ramach projektu THE BALTIC SEA REGIONAL PROJECT (BSRP). Uczestniczyli w nich naukowcy z Finlandii, Rosji, Estonii, Łotwy, Litwy i Polski. Spotkanie było podzielone na dwie części: dyskusyjną, na której uczestnicy prezentowali własne doświadczenia w kwestii mapowania habitatów podwodnych oraz część praktyczną (nurkowanie, mapowanie profili badawczych, opis siedlisk).

W ramach tego projektu Samodzielna Pracownia Ekologii, otrzymała sprzęt stanowiący wyposażenie płetwonurka oraz sprzęt do filmowania i fotografii podwodnej.